روز 2 شهریور 1390 همراه با 30 تن از فعالین فرهنگی، سیاسی – اجتماعی آذربایجان در منزل شخصی مصطفی عوض پور واقع در محله قوم تپه تبریز توسط مامورین امنیتی بازداشت و به بازداشتگاه اداره اطلاعات منتقل شد.
گزارشات رسیده از زندان تبریز خبر از شکنجه و بد رفتاری ماموران امنیتی با بازداشت شدگان اخیر مخصوصا این فعال جوان و شناخته شده می دهد. فرزاد مهدوی به همراه 14 تن دیگر طی حکمی به 4 ماه حبس تعزیری و 20 ماه حبس تعلیقی محکوم شد.فرزاد مهدوی بارها توسط ارگانهای امنیتی بازداشت، و مورد بازجویی و شکنجه قرار گرفته است. در آخرین مورد وی در تاریخ 17 اسفند 1388 و در جریان وقایع بعد از بازی تراختور توسط مامورین امنیتی بازداشت شده بود. پیش از آن نیز وی در تجمعات اعتراضی نسبت به اشغالگری و نسل کشی ارامنه، در مقابل خلیفه گری ارامنه در تبریز بازداشت و مدتی را در بازداشتگاه اداره اطلاعات و زندان تبریز سپری کرده بود.
لازم به توضیح است آقای مهدوی به دلیل شرایط نامناسب جسمانی قبل از بازداشت بر اثر شکنجه های اعمالی در زمان بازداشت و بازجویی های طولانی مدت دچار صدمات شدید بدنی است که این موضوع باعث افزایش نگرانی ها درباره سلامتی این فعال حرکت ملی آذربایجان گردیده است.وی هم اینک به همراه سایر بازداشت شدگان مراسم افطار قوم تپه در زندان مرکزی تبریز در شرایط نامناسبی بسر میبرد.
سازمان عفو بین الملل طی بیانیه ضمن ابراز نگرانی از وضعیت بازداشت شدگان اخیر ،خواستار آزادی بدون قید و شرط آنان شده است.
